В 2019 году исполняется 25 лет со дня основания Владикавказского научного центра. Указом Президента РСО-А Ахсарбека Хаджимурзаевича Галазова № 269 от 27 декабря 1994 г. был организован Государственный научный центр Республики Северная Осетия-Алания для проведения единой научно-технической политики и решения задач социально-экономического развития республики. В 2000 году Центр вошёл в состав Российской академии наук как региональный научный центр РАН, созданный совместно Президиумом РАН и Правительством РСО-А.
В 2013-2015 годах в ходе реформы науки и Российской академии наук и передачи ВНЦ РАН и научных организаций, входящих в его состав, в ведение Федерального агентства научных организаций было принято важное решение – создать на базе ВНЦ РАН Федеральный научный центр «Владикавказский научный центр Российской академии наук» с полным федеральным финансированием, присоединив к нему следующие научные учреждения, подведомственные ФАНО России:
- Геофизический институт ВНЦ РАН
- Институт биомедицинских исследований ВНЦ РАН
- Северо-Кавказский научно-исследовательский институт горного и предгорного сельского хозяйства
- Северо-Осетинский институт гуманитарных и социальных исследований им. В.И. Абаева
- Центр скифо-аланских исследований им. В.И. Абаева
- Южный математический институт ВНЦ РАН.